Генетика бактерий (Девис Р., Ботстайн Д., Дж. Рот)

Генетика бактерий

Автор(ы):Девис Р., Ботстайн Д., Дж. Рот
26.02.2015
Год изд.:1984
Описание: Книга представляет собой практическое руководство по генетической инженерии бактерий, написанное американскими авторами. Подробно изложены методы экспериментов с мигрирующими генетическими элементами, методы конструирования гибридных молекул ДНК, техника работы с фаговыми, плазмидными и бактериальными ДНК. Справочный раздел содержит сведения о наиболее употребляемых средах для культивирования бактерий, условиях хранения штаммов бактерий и препаратов ДНК, ферментах рестрикции, физических картах плазмидных и фаговых векторов и т. д. Предназначена для молекулярных биологов, биохимиков, генетиков, микробиологов, вирусологов.
Оглавление:
Генетика бактерий — обложка книги. Обложка книги.
От редакции [5]
Предисловие [6]
Введение. Структура книги и содержание [9]
  Правила работы и безопасность [10]
  Номенклатура штаммов и мутаций [11]
Список штаммов [15]
Раздел I. Эксперименты.
  Эксперимент 1. Выделение вставок Тn10, приводящих к ауксотрофности [19]
  Эксперимент 2. Выделение вставок Тn10 вблизи определенных генов [24]
  Эксперимент 3. Делеции, вызванные элементом Тn10 [28]
  Эксперимент 4. Локализованный мутагенез [32]
  Эксперимент 5. Выделение и характеристика точковых мутантов фага *, полученных с помощью гидроксиламина [36]
  Эксперимент 6. Выделение делеционных мутантов *amp [38]
  Эксперимент 7. Картирование делеций [39]
  Эксперимент 8. Отбор клонов *gt-his по комплементации [42]
  Эксперимент 9. Гибридизация бляшек [46]
  Эксперимент 10. Гибридизация из геля (блот-гибридизация) [50]
  Эксперимент 11. Электронная микроскопия ДНК [51]
  Эксперимент 12. Субклонирование из фага * в плазмидном векторе [52]
  Эксперимент 13. Встраивание **, направляемое Тn10 [54]
Раздел II. Методики.
  Методика 1. Очистка фага методом бляшек [57]
    I. Клетки-хозяева [57]
    II. А. Штрихование нижнего агара [57]
    II. Б. Штрихование сверху [57]
    III. Отбор бляшки уколом [57]
    IV. Титрование фага [58]
  Методика 2. Получение препаратов фага [60]
    I. Клетки-хозяева [60]
    II. Засев чашек [60]
    III. Сбор фага [60]
  Методика 3. Быстрый метод получения трансдуцирующего фага Р22 [62]
  Методика 4. Очистка фага [63]
    I. Ступенчатые градиенты CsCI для ротора Beckman 50.1 [64]
    II. Равновесный градиент для ротора SW 50.1 [64]
  Методика 5. Транспозиция элемента Тn10 [66]
    I. Получение дефектного трансдуцирующего фага из штамма NK 337 [66]
    II. Добавление отростков к головкам фага Р22 [67]
    III. Транспозиция при трансдукции [69]
  Методика 6. Отбор мутантов Tet* среди штаммов, несущих элемент Тn10 [70]
  Методика 7. Выявление фага *, с функционирующим геном *-лактамазы на чашках Red [71]
  Методика 8. Индукция мутаций гидроксиламином [73]
    I. Выделение мутаций в фаге или клонированном гене (например, в гене *-лактамазы) [73]
    II. Локализованный мутагенез (по котрансдукции) [73]
  Методика 9. Отбор делеционных мутантов фага * [75]
  Методика 10. Тесты на рекомбинацию и комплементацию фага in vivo [77]
    I. Стандартное скрещивание (для определения частоты рекомбинации или для создания рекомбинанта) [77]
    II. Комплементационный тест по размножению фага [73]
    III. Спот-тест на комплементацию мутантов фага (* или Р22) [78]
  Методика 11. Выделение ДНК из фага * [82]
    I. Формамидный метод [82]
    II. Быстрый метод выделения ДНК фага * [84]
    III. Выделение ДНК из термоиндуцибельных лизогенов Sаm7 [86]
    IV. Разделение цепей ДНК фага * [87]
  Методика 12. Выделение плазмидной и бактериальной ДНК [88]
    I. Выделение больших количеств плазмидной ДНК из Е. coli [88]
    II. А. Быстрый метод выделения плазмидной и (или) бактериальной ДНК из колоний или жидких культур [90]
    II. Б. Быстрый метод выделения плазмидной ДНК из 10 мл жидкой культуры [93]
  Методика 13. Удаление бромистого этидия из ДНК, находящейся в растворе CsCl [94]
    Экстракция изопропанолом или бутанолом [94]
  Методика 14. Образование гибридных фагов *gt [95]
    I. Расщепление ДНК [95]
    II. Ковалентное соединение с помощью ДНК-лигазы фагаТ4 [96]
  Методика 15. Упаковка ДНК фага * в вирусные частицы in vitro [97]
    I. Упаковка [97]
    II. Получение индуцированных упаковывающих клеток [98]
  Методика 16. Трансфекция ДНК фага * [99]
    I. Выращивание клеток [99]
    II. Приготовление клеток [99]
    III. Заражение клеток ДНК [100]
    IV. Хранение клеток [100]
  Методика 17. Субклонирование фрагментов ДНК в векторах-плазмидах Е. coli [101]
  Методика 18. Трансформация плазмидной ДНК [102]
  Методика 19. Способность гибридного фага к комплементации в клетках E. coli [104]
    I. Литический отбор из пула гибридов Е. coli [104]
    II. Отбор из пула гибридов по двойным лизогенам [105]
  Методика 20. Электрофорез в агарозном геле [108]
    I. Агарозный гель [108]
    II. Окрашивание ДНК в агарозных гелях [111]
    III. Фотографирование гелей, содержащих нуклеиновые кислоты [112]
    IV. Гели с глиоксалем [113]
  Методика 21. Перенос ДНК на нитроцеллюлозу или диазотированную бумагу [115]
    I. Перенос из агарозных гелей [115]
    II. Перенос из бляшек фага * [117]
    III. Перенос из бактериальных колоний [120]
  Методика 22. Внесение метки а-32Р в ДНК с помощью ник-трансляции [121]
    I. Реакция [121]
    II. Дезоксирибонуклеозидтрифосфаты (dNTP) [122]
    III. ДНКаза [122]
    IV. Проверка включения 32p в ДНК [123]
    V. Выделение меченой ДНК [123]
    VI. Общие замечания [124]
  Методика 23. Гибридизация с иммобилизованной ДНК или РНК на твердом носителе [125]
  Методика 24. Радиоавтография 32p, связавшегося с фильтром [129]
  Методика 25. Выделение ДНК из агарозного геля [130]
    I. Использование стеклянных фильтров [130]
    II. Равновесное центрифугирование в градиенте плотности KI [131]
    III. Электроэлюция ДНК в гидроксилапатит [ 132]
  Методика 26. Быстрая оценка концентрации ДНК с использованием бромистого этидия [133]
    I. Метод с использованием чашки с агарозой [133]
    II. Метод с использованием пластиковой пленки, натянутой на кольцо [133]
  Методика 27. Электронная микроскопия ДНК [134]
    I. Водная методика [134]
    II. Формамидная методика [134]
  Методика 28. Обычная методика образования гетеродуплексов [136]
    I. Образование гетеродуплексов [136]
    II. Электронная микроскопия гетеродуплексов [136]
  Методика 29. Выделение ферментных препаратов из клеток, лизогенных по фагу **857 Sam7 [137]
    I. Методики, общие для всех ферментов [137]
    II. Очистка ДНК-полимеразы I из лизата клеток Е. coli 594 [138]
    III. ДНК-лигаза фага Т4 из лизата клеток Е. coli E150 [139]
Раздел III. Приложения.
  Приложение 1. Среды, концентрации лекарственных препаратов, пищевые добавки [141]
    I. Среды [141]
    II. Концентрации антибиотиков [145]
    III. Пищевые добавки [145]
  Приложение 2. Диагностика ауксотрофов (ауксанография) [146]
  Приложение 3. Хранение бактерий, фагов и ДНК [148]
    I. Хранение бактерий и фагов [148]
    II. Методики хранения [149]
    III. Хранение ДНК [149]
  Приложение 4. Буферы и растворы [151]
    I. Буферы [151]
    II. Концентрации растворов [153]
  Приложение 5. Подготовка трубок для диализа [153]
  Приложение 6. Измерение объемов, единицы [154]
    I. Измерение микролитровых объемов [154]
    II. Температура плавления ДНК [155]
    III. Время осветления [156]
    IV. Единицы [157]
  Приложение 7. Расщепление рестриктирующими эндонуклеазами [157]
    I. Методика [157]
    II. Свойства рестриктирующих эндонуклеаз [158]
  Приложение 8. Емкость векторов, образуемых на основе фага * [160]
  Приложение 9. Рестрикционные карты [161]
    I. Карты фага * и векторов, образуемых на основе фага * [161]
    II. Карта плазмиды pBR322 [162]
  Приложение 10. Карта делений в гистидиновом опероне [163]
  Приложение 11. Шаблоны [164]
Формат: djvu
Размер:1985171 байт
Язык:РУС
Рейтинг: 613 Рейтинг
Открыть: Ссылка (RU)