Математическая биофизика клетки
Автор(ы): | Иваницкий Г. Р.
06.10.2007
|
Год изд.: | 1978 |
Описание: | В книге рассмотрены математическое моделирование ферментативных реакций и полиферментных систем, модели возбудимых мембран и тканей, моделирование и реконструкция различных внутриклеточных структур. Содержится теоретический и экспериментальный материал, основанный на методах электронной микроскопии, когерентной оптики, а также на качественных методах анализа в приложении к проблемам формальной химической кинетики, ионных токов мембран, распространения волн возбуждения, сокращения сердечной мышцы, машинного анализа биоструктур. |
Оглавление: |
Обложка книги.
ОТ АВТОРОВ [3]ВВЕДЕНИЕ [4] 1. МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ БИОХИМИЧЕСКИХ СИСТЕМ Глава первая. МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ НЕПРОТОЧНЫХ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ [14] 1.1. Два направления в моделировании ферментативных реакций [14] 1.2. Ферменты — белковые катализаторы и регуляторы [16] 1.3. Метод графов [21] 1.4. Модели реакций, катализируемых одноцентровыми ферментами [25] 1.5. Модели реакций, катализируемые олигомерными ферментами [30] 1.6. Свойства реакции S(?)(???)S(?) [37] 1.7. Свойства двухсубстратной реакции S1+S2(???)S3+S4 [44] Глава вторая. МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПРОТОЧНЫХ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ [46] 2.1 Общие методы исследования системы обыкновенных дифференциальных уравнений второго порядка [46] 2.2. Модель открытой реакции S1(?)S2 с субстратным угнетением [52] 2.3. Модель двухсубстратной реакции с субстратным угнетением [59] 2.4. Динамика открытых реакций, катализируемых олигомерными ферментами [64] 2.5. Разнообразие поведения открытых ферментативных реакций [68] 2.6. Эквивалентные математические и кинетические модели [73] 2.7. Эффект депонирования [76] Глава третья. МОДЕЛИРОВАНИЕ ПОЛИФЕРМЕНТНЫХ СИСТЕМ [77] 3.1. Полиферментные системы и их модели [77] 3.2. Уровни функциональной организации полиферментных систем [79] 3.3. Простая модель стехиометрической структуры энергетического метаболизма [85] 3.4. Два класса аллостерических регуляторных связей, контролирующих энергетический метаболизм [92] 2. МАТЕМАТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ ВОЗБУДИМЫХ МЕМБРАН Глава четвертая. КАЧЕСТВЕННЫЕ МЕТОДЫ В ИССЛЕДОВАНИИ МОДЕЛЕЙ МЕМБРАН [102] 4.1. Построение уравнений второго порядка для моделей Ходжкина—Хаксли и Нобла. Точность аппроксимации [103] 4.2. Фазовые портреты систем второго порядка [108] 4.3. Исследование основных режимов мембраны аксона кальмара с помощью качественных методов [109] 4.4. Исследование основных режимов мембраны волокна Пуркинье сердца с помощью качественных методов [115] 4.5. Математические детали асимптотического сведения уравнений Ходжкина — Хаксли к системе второго порядка Н—Н2 [119] Глава пятая. БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫЕ ВЕЩЕСТВА, ИОННЫЕ ТОКИ И ЭЛЕКТРОФИЗИОЛОГИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ МЕМБРАН [122] 5.1. Построение фазового портрета мембраны по записям ионных токов при фиксации потенциала.„„ 5.2. Техника анализа мембран по записям ионных токов [125] 5.3. Фазовые портреты мембран сердечной, нервной и мышечной клеток [129] 5.4. Анализ действия веществ на мембраны [131] 5.5. Предсказание электрофизиологических эффектов с помощью качественных методов [134] 5.6. Границы применимости анализа мембран по фазовому портрету [137] 5.7. Оценка на математических моделях мембран точности построения фазового портрета по записям ионных токов [138] 3. ВОЗБУДИМЫЕ СРЕДЫ. ВОЛНЫ И АВТОВОЛНОВЫЕ ПРОЦЕССЫ Глава шестая. РЕВЕРБЕРАТОР - ИСТОЧНИК СПИРАЛЬНЫХ ВОЛН В ВОЗБУДИМЫХ СРЕДАХ [141] 6.1. Автоволновые процессы в возбудимых средах [141] 6.2. Распространение волн в однородной среде. Спиральная волна, вращающаяся вокруг отверстия, и ревербератор [144] 6.3. Возникновение ревербератора в простейшей неоднородной среде [147] 6.4. Ревербератор в более детальных моделях [152] 6.5. Свойства ревербератора как источника волн. Размножение ревербераторов в неоднородной среде. Время жизни [153] 6.6. Ревербератор и сердечные аритмии. Уязвимость сердечной ткани [157] Глава седьмая. ЭХО — ИСТОЧНИК КОНЦЕНТРИЧЕСКИХ ВОЛН В ВОЗБУДИМЫХ СРЕДАХ [160] 7.1. Эхо в простейших моделях. Источник эха и ревербератор [161] 7.2. Источник эха в моделях, описываемых обыкновенными дифференциальными уравнениями [166] 7.3. Эхо в непрерывных возбудимых средах [169] 7.4. Эхо в модели клеток сердца. Уязвимость [172] Глава восьмая. ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ИСТОЧНИКОВ ВОЛН АВТОВОЛНОВЫЕ ПРОЦЕССЫ И СЕРДЕЧНЫЕ АРИТМИИ [175] 8.1. Фибрилляция сердечной мышцы [175] 8.2. Синхронизация при взаимодействии источников волн [177] 8.3. Размножение ревербераторов и фибрилляция [178] 8.4. Взаимодействие источников эха [181] 8.5. Связь параметров возбудимых сред с характеристиками дифференциального уравнения мембраны [185] 8.6. Стационарные и нестационарные режимы распространения [190] 8.7. Результаты микроэлектродного исследования уязвимости [194] 8.8. О параметрах, контролирующих уязвимость в математических моделях и в миокарде [196] 8.9. Следствия из моделей для антиаритмических веществ [198] 4. ПРОСТРАНСТВЕННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ БИОЛОГИЧЕСКИХ СТРУКТУР Глава девятая. МОДЕЛИРОВАНИЕ ОБЪЕМНЫХ КЛЕТОЧНЫХ СТРУКТУР ВИРУСЫ, ФЕРМЕНТЫ [202] 9.1. Процесс формирования изображений [202] 9.2. Математические основы объемной реконструкции [207] 9.3. Модель трехмерной структуры отростка бактериофага [216] 9.4. Голографический синтез объемного изображения поверхности клеточной мембраны [226] 9.5. Моделирование структуры биологических макромолекул [232] Глава десятая. АНАЛИЗ КЛЕТОЧНЫХ СТРУКТУР ПО ИХ ИЗОБРАЖЕНИЯМ ГЛИЯ - СОСУДЫ, ХРОМОСОМЫ [238] 10.1. Преобразование изображений клеток в цифровую форму [238] 10.2. Определение морфометрических параметров клеток и клеточных структур [243] 10.3. Исследование глиально-сосудистой системы головного мозга [255] 10.4. Модель сокращения длины хромосом в митозе [261] Глава одиннадцатая. ВОССТАНОВЛЕНИЕ ЛИНЕЙНОЙ СТРУКТУРЫ БИОПОЛИМЕРОВ [266] 11.1 Анализ первичной последовательности нуклеиновых кислот [266] 11.2. Математическая постановка проблемы [268] 11.3. Восстановление слов по составу второго ранга [273] 11.4. Метод подстановки при восстановлении слов [274] 11.5. Оптимизация биохимического эксперимента [277] ЛИТЕРАТУРА [280] ПРЕДМЕТНЫЙ УКАЗАТЕЛЬ [301] |
Формат: | djvu |
Размер: | 2886736 байт |
Язык: | РУС |
Рейтинг: | 156 |
Открыть: | Ссылка (RU) |