Биохимия. Т. 1
Автор(ы): | Страйер Л.
06.10.2007
|
Год изд.: | 1984 |
Описание: | "В книге ученого из США на самом современном научном уровне рассмотрены основные проблемы биохимии и молекулярной биологии. На русском языке книга выходит в трех томах. В первом томе приведены данные по строению биологических макромолекул, образованию, превращению и хранению энергии в клетке, структуре и функциям ферментов и других биологически активных белков, а также "молекулярным" болезням." |
Оглавление: |
Обложка книги.
Предисловие редактора перевода [5]Предисловие ко второму изданию [6] Предисловие к первому изданию [7] Глава 1. Молекулы и жизнь [9] 1.1. Молекулярные модели [10] 1.2. Пространство, время и энергия [11] 1.3. Структура данной книги [13] Часть I. Конформация и динамика Глава 2. Основные представления о структуре и функции белков [18] 2.1. Белки построены из аминокислот [19] 2.2. Особые аминокислоты дополняют основной набор, насчитывающий двадцать аминокислот [21] 2.3. Аминокислоты, соединяясь пептидной связью, образуют полипептидные цепи [23] 2.4. Белки состоят из одной или нескольких полипептидных цепей [24] 2.5. Для очистки белков можно использовать множество различных методов [24] 2.6. Последовательность аминокислот в белках уникальна и детерминируется генами [26] 2.7. Экспериментальные методы определения последовательности аминокислот [27] 2.8. Конформация полипептидных цепей [32] 2.9. Периодичные структуры: альфа-спираль, бета-складчатый слой, спираль коллагена [34] 2.10. Полипептидная цепь может поворачиваться на 180° благодаря образованию (?)-изгибов [37] 2.11. Структурные уровни в архитектуре белков [37] 2.12. Последовательность аминокислот определяет трехмерную структуру [38] 2.13. Формирование свернутой молекулы белков происходит путем ассоциации (?)-спиралей и складчатых (?)-слоев [41] Заключение [42] Приложение. Понятия кислотности и основности [45] Вопросы и задачи [47] Глава 3. Переносчики кислорода-миоглобин и гемоглобин [48] 3.1. Кислород присоединяется к простетической группе тема [48] 3.2. Рентгеноструктурный анализ кристаллов выявляет пространственное расположение атомов [50] 3.3. Этапы рентгеноструктурного анализа миоглобина [51] 3.4. Структура миоглобина характеризуется компактностью и высокой степенью (?)-спирализованности [54] 3.5. Участок связывания кислорода в миоглобине [56] 3.6. Жесткое окружение тема обеспечивает обратимость оксигенирования [58] 3.7. Присутствие дистального гистидина снижает связывание окиси углерода [60] 3.8. В растворенном виде и в кристаллическом состоянии миоглобин имеет практически одинаковую структуру [60] 3.9. Неполярные взаимодействия играют важную роль в стабилизировании конформации миоглобина [61] 3.10. Развернутая молекула миоглобина спонтанно принимает функционально активную конфигурацию [62] 3.11. Гемоглобин состоит из четырех полипептидных цепей [63] 3.12. Рентгеноструктурный анализ гемоглобина [63] 3.13. Четвертичная структура гемоглобина [64] 3.14. (?)- и (?)-цепи гемоглобина очень сходны с миоглобином [64] 3.15. Критически необходимые остатки в последовательности аминокислот [65] 3.16. Возникновение гемоглобина-новый этап в эволюции [66] Заключение [66] Вопросы и задачи [68] Глава 4. Гемоглобин: аллостерический белок [69] 4.1. Функциональные различия между миоглобином и гемоглобином [69] 4.2. Кооперативность связывания кислорода гемоглобином [69] 4.3. Кооперативное связывание кислорода гемоглобином увеличивает транспорт кислорода [72] 4.4. Н(?) и СО(?) способствуют высвобождению О(?) (эффект Бора) [72] 4.5. Бисфосфоглицерат снижает сродство к кислороду [73] 4.6. Клиническое значение бисфосфоглицерата [74] 4.7. Гемоглобин плода характеризуется высоким сродством к кислороду [75] 4.8. Для проявления аллостерического эффекта необходимо взаимодействие субъединиц [75] 4.9. Четвертичная структура гемоглобина значительно изменяется при оксигенировании [76] 4.10. Солевые связи между отдельными цепями придают жесткость структуре дезоксигемоглобина [77] 4.11. При оксигенировании атом железа перемещается в плоскость порфирина [77] 4.12. Движение атома железа передается на другие субъединицы через проксимальный гистидин [79] 4.13. Механизм кооперативного связывания кислорода [79] 4.14. Бисфосфоглицерат снижает сродство к кислороду путем образования перекрестных связей с дезоксигемоглобином [80] 4.15. СО(?) присоединяется к концевым аминогруппам гемоглобина снижая его сродство к кислороду [81] 4.16. Механизм эффекта Бора [81] 4.17. Коммуникация внутри белковой молекулы [84] Заключение [84] Вопросы и задачи [85] Глава 5. Молекулярные болезни: серповидноклеточная анемия [88] 5.1. Серповидноклеточная анемия-хроническая гемолитическая болезнь, передающаяся по наследству [89] 5.2. Дезоксигенированный серповидноклеточный гемоглобин имеет пониженную растворимость [90] 5.3. Гемоглобин S отличается от гемоглобина А по электрофоретической подвижности [90] 5.4. Получение пептидных карт: выявление аминокислотной замены в гемоглобине серповидных клеток [92] 5.5. В (?)-цепи произошла замена одной-единственной аминокислоты [93] 5.6. На поверхности гемоглобина серповидных клеток имеются «липкие участки» [94] 5.7. Дезоксигемоглобин S образует длинные спирализованные волокна [95] 5.8. Скорость образования волокон в высокой степени зависит от концентрации дезоксигемоглобина S [95] 5.9. Высокая частота гена серповидноклеточности обусловлена его защитным эффектом в отношении малярии [97] 5.10. Стратегия поиска лекарственных средств для лечения серповидноклеточной анемии [97] 5.11. Молекулярная патология гемоглобина [98] 5.12. Гемоглобин М; продукт мутации в активном центре [99] 5.13. Полярные группы в щели, занимаемой гемом, ослабляют его связывание с полипептидной цепью [99] 5.14. В результате некоторых мутаций гемоглобины утрачивают стабильность из-за деформаций третичной структуры [99] 5.15. Мутации в области контактов нарушают аллостерические взаимодействия [100] 5.16. Значение открытия мутантных гемоглобинов [101] Заключение [101] Вопросы и задачи [102] Глава 6. Введение в энзимологию [104] 6.1. Ферменты обладают огромной каталитической силой [104] 6.2. Ферменты обладают высокой специфичностью [104] 6.3. Активность некоторых ферментов регулируется [105] 6.4. Ферменты осуществляют трансформацию различных видов энергии [106] 6.5. Ферменты не сдвигают равновесия реакции [107] 6.6. Ферменты снижают энергию активации катализируемых ими реакций [107] 6.7. Первый этап ферментативного катализа-образование фермент-субстратного комплекса [108] 6.8. Некоторые свойства активных центров [109] 6.9. Кинетика многих ферментов описывается моделью Михаэлиса-Ментен [111] 6.10. Ктах и Хм можно определить, используя различные концентрации субстрата [112] 6.11. Значение величин Км и Vmax [113] 6.12. О степени совершенства кинетики ферментативного катализа судят по критерию (?) [114] 6.13. Ферменты могут ингибироваться специфическими молекулами [114] 6.14. Конкурентное и неконкурентное ингибирование различаются по кинетике [116] 6.15. Лечение отравления этиленгликолем на основе конкурентного ингибирования [117] 6.16. Аллостерические ферменты не подчиняются кинетике Михаэлиса-Ментен [118] 6.17. Согласованный механизм аллостерических взаимодействий [118] 6.18. Последовательный механизм аллостерического взаимодействия [121] 6.19. Водородные связи, а также электростатические и вандерваальсовы взаимодействия в фермент-субстратных комплексах [122] 6.20. Заряженные субстраты могут связываться с противоположно заряженными группами фермента [122] 6.21. При связывании субстратов с ферментами образуются строго ориентированные водородные связи [122] 6.22. Белки обладают выраженной способностью к образованию водородных связей [123] 6.23. Вандерваальсовы взаимодействия играют важную роль в случаях стерической комплементарности [124] 6.24. Биологически важные свойства воды: полярность воды и ее способность к когезии [125] 6.25. Присутствие воды ослабляет полярные взаимодействия [126] 6.26. Гидрофобные взаимодействия: в водной среде неполярные группы стремятся ассоциировать [127] Заключение [127] Вопросы и задачи [130] Глава 7. Механизм действия ферментов: лизоцим и карбоксипептндаза [132] 7.1. Лизоцим расщепляет клеточные стенки бактерий [132] 7.2. Трехмерная структура лизоцима [133] 7.3. Поиски активного центра лизоцима [134] 7.4. Способ связывания конкурентного ингибитора [136] 7.5. От структуры фермента - к механизму ферментативного действия [136] 7.6. Промежуточное образование иона карбония - критический этап катализа [140] 7.7. Экспериментальное доказательство предложенного механизма ферментативного катализа [141] 7.8. Карбоксипептидаза А: протеолитический фермент, содержащий цинк [144] 7.9. Связывание субстрата индуцирует большие структурные изменения активного центра карбоксипептидазы А [146] 7.10. Скорость катализа карбоксипептидазой А возрастает благодаря смещению электронов [148] Заключение [149] Вопросы и задачи [151] Глава 8. Активация проферментов: пищеварительные ферменты и факторы свертывания крови [152] 8.1. Активация химотрипсиногена происходит путем специфического расщепления одной пептидной связи [152] 8.2. Трехмерная структура химотрипсина [153] 8.3. Химотрипсин специфичен в отношении ароматических и больших неполярных боковых цепей [154] 8.4. При катализе химотрипсином часть субстрата ковалентно связывается с ферментом [154] 8.5. Ацильная группа соединяется с необычайно реакционноспособным остатком серина на ферменте [156] 8.6. Участие гистидина-57 в катализе выявляется с помощью аффинной метки [157] 8.7. Система переноса заряда обеспечивает челночную передачу протона при катализе [158] 8.8. В химотрипсине имеется глубокий карман для связывания ароматической боковой цепи [158] 8.9. В процессе катализа образуется переходное тетраэдрическое промежуточное соединение [159] 8.10. Механизм активации профермента [160] 8.11. Трипсин и эластаза: вариации на тему [161] 8.12. Ингибитор панкреатического трипсина прочно связывается в активном центре трипсина [162] 8.13. Дивергентная и конвергентная эволюция сериновых протеиназ [163] 8.14. Координированная активация панкреатических проферментов [165] 8.15. Преждевременная активация проферментов может приводить к летальному исходу, в частности при панкреатите [165] 8.16. Основные типы протеолитических ферментов-это серииовые протеиназы и карбоксипротеиназы [165] 8.17. Свертывание крови как каскад реакций активации проферментов [166] 8.18. Образование кровяного сгустка требует взаимодействия двух типов ферментативных превращений [167] 8.19. Фибриноген превращается в фибриновый сгусток под действием тромбина [167] 8.20. Мономеры фибрина спонтанно образуют фибриллы [168] 8.21. Сгусток фибрина стабилизирован ковалентными поперечными связями [169] 8.22. Тромбин гомологичен трипсину [169] 8.24. На фосфолипидной поверхности тромбоцитов протромбин активируется фактором Х(?) [171] 8.25. Гемофилия и другие формы нарушения свертывания крови позволили выявить ряд начальных этапов образования кровяного сгустка [172] 8.26. Внутренний механизм свертывания крови [173] 8.27. Внешний механизм свертывания крови [174] 8.28. Контроль свертывания крови: проблема, требующая внимания [175] Заключение [176] Вопросы и задачи [177] Глава 9. Белки соединительной ткани: коллаген, эластин и протеогликаны [179] 9.1. Тропоколлаген как основная структурная единица коллагена [179] 9.2. Коллаген обладает необычным составом и необычной последовательностью аминокислот [180] 9.3. Некоторые остатки пролина и лизина в коллагене гидроксилируются [180] 9.4. К остаткам гидроксилизина присоединены сахара [182] 9.5. Структура тропоколлагена-это тройной спирально скрученный тяж [182] 9.6. Малые размеры глицина делают его незаменимым компонентом структуры [184] 9.7. Стабильность спирали коллагена зависит от кооперативных взаимодействий [184] 9.8. Нарушение гидроксилирования-один из биологических дефектов при цинге [186] 9.9. Проколлаген-предшественник коллагена при его биосинтезе [187] 9.10. Дополнительные пептиды цепей-предшественников отщепляются ферментативно [188] 9.11. Коллагеновое волокно состоит из ступенчато расположенных молекул тропоколлагена [188] 9.12. Образование коллагенового волокна регулируется проколлаген-пептидазами [189] 9.13. Поперечные связи повышают прочность коллагенового волокна [190] 9.14. Коллагеназы-ферменты, специфически расщепляющие коллаген [191] 9.15. Эластин-каучукоподобный белок эластических волокон [192] 9.16. Протеогликаны образуют основное вещество соединительной ткани [193] Заключение [195] Вопросы и задачи [198] Глава 10. Введение в проблему биологических мембран [199] 10.1. Общие свойства биологических мембран [200] 10.2. Фосфолип иды-основной класс мембранных липидов [201] 10.3. В большинстве мембран имеются также гликолипиды и холестерол [203] 10.4. Фосфолипиды и гликолипиды легко образуют бислои [204] 10.5. Липидные бислои-нековалентные кооперативные структуры [205] 10.6. Липидные бислои непроницаемы для ионов и многих полярных молекул [206] 10.7. Большинство мембранных процессов опосредовано белками [208] 10.8. Реконструкция функционирующих мембранных систем из очищенных компонентов [209] 10.9. Отдельные белки мембран глубоко погружены в липидный бислои [210] 10.10. В мембране эритроцитов содержатся различные периферические и интегральные белки [211] 10.11. Мембрану эритроцита пронизывают канал для анионов и сложный белок гликофорин [213] 10.12. Углеводные единицы расположены на наружной стороне плазматической мембраны [214] 10.13. Липиды и многие мембранные белки быстро диффундируют в плоскости мембраны [215] 10.14. Мембранные белки не перемещаются поперек бислоев [218] 10.15. Жидкостно-мозаичная модель биологических мембран [219] 10.16. Мембранам свойственна асимметрия [219] 10.17. Текучесть мембран зависит от состава жирных кислот и содержания холестерола [219] 10.18. Трехмерная модель мембран по данным электронной микроскопии [221] Заключение [222] Вопросы и задачи [223] Ответы на вопросы и задачи [225] |
Формат: | djvu |
Размер: | 6783315 байт |
Язык: | RUS |
Рейтинг: | 143 |
Открыть: | Ссылка (RU) |