Итоги науки и техники. Т. 17. Ферменты рестрикции и их применение

Автор(ы):Янулайтис А. А.
06.10.2007
Год изд.:1989
Описание: Представляемый читателям обзор А. Янулайтиса содержит исчерпывающую информацию относительно важного класса ферментов— специфических эндонуклеаз рестрикции II класса. Именно эти ферменты служат одним из главных орудий генных инженеров, лежат в основе методов физического картирования геномов, анализа последовательности нуклеотидов в ДНК. Обзор охватывает литературу до 1988 г. включительно и может служить полезным справочным материалом для широкого круга исследователей, применяющих рестриктазы II класса в своей, работе. Сегодня исследование рестриктаз II класса, поиск новых ферментов, изучение способов их взаимодействия с ДНК, их каталитическая активность стали предметом самостоятельной области энзимологии. Все эти вопросы нашли полное изложение и критическое осмысливание в обзоре.
Оглавление:
Итоги науки и техники. Т. 17. Ферменты рестрикции и их применение — обложка книги. Обложка книги.
От редактора [3]
Л. А. Янулайтис. Ферменты рестрикции и их применение [4]
Введение [4]
Часть I. ФЕРМЕНТЫ РЕСТРИКЦИИ II ТИПА [6]
  1. Ферменты рестрикции, их номенклатура и классификация [6]
  2. Распространение рестриктаз [12]
  3. Таксоиоспецифичность рестриктаз [25]
  4. Характеристика субстратной специфичности рестриктаз [33]
    4.1. Узнаваемая последовательность нуклеотидов [33]
    4.2. Релаксироваиная специфичность рестриктаз [41]
    4.3. Место расщепления субстрата [43]
    4.4. Специфичность рестриктаз в отношении природных модификаций основания [45]
      4.4.1. Специфичность рестриктаз по отношению к местоположению модифицированного основания [47]
      4.4.2. Чувствительность рестриктаз к природе минорного основания [48]
      4.4.3. Сводные данные о чувствительности рестриктаз к модификациям субстрата [49]
      4.4.4. Чувствительность изошизомеров к местоположению метилированного основания [57]
      4.4.5. Чувствительность рестриктаз к (?)CG и (?)CNG метилированию субстрата [58]
      4.4.6. Чувствительность рестриктаз к dam и dcm зависимому метилированию [58]
      4.4.7. Чувствительность метилаз к модификациям субстрата [62]
    4.5. Практическое применение сведений о различных проявлениях субстратной специфичности рестриктаз [63]
  5. Физико-химические свойства рестрикционных эндонуклеаз [66]
  6. Ферментативные свойства рестриктаз [68]
    6.1. Каталитические свойства рестрикционных эндонуклеаз [69]
      6.1.1. Эффективные кинетические параметры [69]
      6.1.2. Механизм реакции гидролиза кольцевых форм ДНК эндонуклеазами рестрикции [70]
      6.1.3. Исследование процесса гидролиза линейных форм ДНК эндонуклеазами рестрикции [74]
      6.1.4. Гидролиз синтетических олигонуклеотидов эндонуклеазами рестрикции [76]
      6.1.5. Расщепление однонитевой ДНК эндонуклеазами рестрикции [77]
  7. Взаимодействие рестриктаз II типа с модифицированными субстратами [78]
    7.1. Роль отдельных групп атомов гетероциклических оснований участка узнавания [79]
      7.1.1. Аденин [80]
      7.1.2. Тимин [82]
      7.1.3. Цитозин [84]
      7.1.4. Гуанин [87]
    7.2. Влияние нуклеотидных последовательностей, фланкирующих участок узнавания [88]
    7.3. Взаимодействие рестриктаз с углеводфосфатным остовом участка узнавания [90]
      7.3.1. Фосфатные группы [90]
      7.3.2. Углеводный остаток [92]
    7.4. Некоторые аспекты взаимодействия рестриктаз с отдельным нуклеотидом (или его звеном) участка узнавания [94]
  8. Рентгеноструктурное исследование комплекса рестриктазы EcoR I с субстратом [96]
  9. Молекулярная генетика ферментов рестрикции-модификации [100]
    9.1. Структура генов рестрикции-модификации [101]
    9.2 Регуляция экспрессии генов рестрикции-модификации [104]
      9.2.1. Структура регуляторных областей генов rm [105]
      9.2.2. Возможные механизмы скоординированной экспрессии генов rm [107]
    9.3. Гомология генов, кодирующих ферменты рестрикции-модификации [114]
        Литература [116]
Часть II. МЕТОДИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ РЕСТРИКТАЗ [126]
  1. Определение активности рестриктаз [126]
  2. Поиск продуцентов рестриктаз [130]
    2.1. Биологические подходы к поиску продуцентов рестриктаз [131]
    2.2. Биохимические методы поиска продуцентов специфических эндонуклеаз [135]
  3. Очистка рестриктаз [141]
    3.1. Получение бесклеточных экстрактов [144]
    3.2. Разделение нуклеиновых кислот и рестриктаз [144]
      3.2.1. Нехроматографические методы [145]
      3.2.2. Хроматографические методы разделения нуклеиновых кислот и рестриктаз [148]
    3.3. Методы, используемые для очистки рестриктаз [154]
    3.4. Возможные перспективные направления развития препаративной биохимии рестриктаз [160]
      3.4.1. Высокоэффективная жидкостная хроматография [160]
      3.4.2. Новые методические подходы к разработке схем очистки [161]
    3.5. Выделение гомогенных препаратов рестриктаз [162]
  4. Определение субстратной специфичности рестриктаз [170]
    4.1. Косвенные методы определения узнаваемого участка [170]
    4.2. Методы определения места расщепления субстрата [173]
  5. Клонирование генов рестрикции-модификации [180]
    5.1. Методические аспекты клонирования генов rm [185]
    5.2. Факторы, влияющие на успешное клонирование генов rm [188]
      5.2.1. Скоординированная экспрессия [188]
      5.2.2. Ограничение модифицированной ДНК [191]
    5.3. Конструирование продуцентов рестриктаз и метилаз [193]
        Литература [195]
Формат: djvu
Размер:1675329 байт
Язык:RUS
Рейтинг: 32 Рейтинг
Открыть: Ссылка (RU)