Итоги науки и техники. Т. 17. Ферменты рестрикции и их применение
Автор(ы): | Янулайтис А. А.
06.10.2007
|
Год изд.: | 1989 |
Описание: | Представляемый читателям обзор А. Янулайтиса содержит исчерпывающую информацию относительно важного класса ферментов— специфических эндонуклеаз рестрикции II класса. Именно эти ферменты служат одним из главных орудий генных инженеров, лежат в основе методов физического картирования геномов, анализа последовательности нуклеотидов в ДНК. Обзор охватывает литературу до 1988 г. включительно и может служить полезным справочным материалом для широкого круга исследователей, применяющих рестриктазы II класса в своей, работе. Сегодня исследование рестриктаз II класса, поиск новых ферментов, изучение способов их взаимодействия с ДНК, их каталитическая активность стали предметом самостоятельной области энзимологии. Все эти вопросы нашли полное изложение и критическое осмысливание в обзоре. |
Оглавление: |
Обложка книги.
От редактора [3]Л. А. Янулайтис. Ферменты рестрикции и их применение [4] Введение [4] Часть I. ФЕРМЕНТЫ РЕСТРИКЦИИ II ТИПА [6] 1. Ферменты рестрикции, их номенклатура и классификация [6] 2. Распространение рестриктаз [12] 3. Таксоиоспецифичность рестриктаз [25] 4. Характеристика субстратной специфичности рестриктаз [33] 4.1. Узнаваемая последовательность нуклеотидов [33] 4.2. Релаксироваиная специфичность рестриктаз [41] 4.3. Место расщепления субстрата [43] 4.4. Специфичность рестриктаз в отношении природных модификаций основания [45] 4.4.1. Специфичность рестриктаз по отношению к местоположению модифицированного основания [47] 4.4.2. Чувствительность рестриктаз к природе минорного основания [48] 4.4.3. Сводные данные о чувствительности рестриктаз к модификациям субстрата [49] 4.4.4. Чувствительность изошизомеров к местоположению метилированного основания [57] 4.4.5. Чувствительность рестриктаз к (?)CG и (?)CNG метилированию субстрата [58] 4.4.6. Чувствительность рестриктаз к dam и dcm зависимому метилированию [58] 4.4.7. Чувствительность метилаз к модификациям субстрата [62] 4.5. Практическое применение сведений о различных проявлениях субстратной специфичности рестриктаз [63] 5. Физико-химические свойства рестрикционных эндонуклеаз [66] 6. Ферментативные свойства рестриктаз [68] 6.1. Каталитические свойства рестрикционных эндонуклеаз [69] 6.1.1. Эффективные кинетические параметры [69] 6.1.2. Механизм реакции гидролиза кольцевых форм ДНК эндонуклеазами рестрикции [70] 6.1.3. Исследование процесса гидролиза линейных форм ДНК эндонуклеазами рестрикции [74] 6.1.4. Гидролиз синтетических олигонуклеотидов эндонуклеазами рестрикции [76] 6.1.5. Расщепление однонитевой ДНК эндонуклеазами рестрикции [77] 7. Взаимодействие рестриктаз II типа с модифицированными субстратами [78] 7.1. Роль отдельных групп атомов гетероциклических оснований участка узнавания [79] 7.1.1. Аденин [80] 7.1.2. Тимин [82] 7.1.3. Цитозин [84] 7.1.4. Гуанин [87] 7.2. Влияние нуклеотидных последовательностей, фланкирующих участок узнавания [88] 7.3. Взаимодействие рестриктаз с углеводфосфатным остовом участка узнавания [90] 7.3.1. Фосфатные группы [90] 7.3.2. Углеводный остаток [92] 7.4. Некоторые аспекты взаимодействия рестриктаз с отдельным нуклеотидом (или его звеном) участка узнавания [94] 8. Рентгеноструктурное исследование комплекса рестриктазы EcoR I с субстратом [96] 9. Молекулярная генетика ферментов рестрикции-модификации [100] 9.1. Структура генов рестрикции-модификации [101] 9.2 Регуляция экспрессии генов рестрикции-модификации [104] 9.2.1. Структура регуляторных областей генов rm [105] 9.2.2. Возможные механизмы скоординированной экспрессии генов rm [107] 9.3. Гомология генов, кодирующих ферменты рестрикции-модификации [114] Литература [116] Часть II. МЕТОДИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ РЕСТРИКТАЗ [126] 1. Определение активности рестриктаз [126] 2. Поиск продуцентов рестриктаз [130] 2.1. Биологические подходы к поиску продуцентов рестриктаз [131] 2.2. Биохимические методы поиска продуцентов специфических эндонуклеаз [135] 3. Очистка рестриктаз [141] 3.1. Получение бесклеточных экстрактов [144] 3.2. Разделение нуклеиновых кислот и рестриктаз [144] 3.2.1. Нехроматографические методы [145] 3.2.2. Хроматографические методы разделения нуклеиновых кислот и рестриктаз [148] 3.3. Методы, используемые для очистки рестриктаз [154] 3.4. Возможные перспективные направления развития препаративной биохимии рестриктаз [160] 3.4.1. Высокоэффективная жидкостная хроматография [160] 3.4.2. Новые методические подходы к разработке схем очистки [161] 3.5. Выделение гомогенных препаратов рестриктаз [162] 4. Определение субстратной специфичности рестриктаз [170] 4.1. Косвенные методы определения узнаваемого участка [170] 4.2. Методы определения места расщепления субстрата [173] 5. Клонирование генов рестрикции-модификации [180] 5.1. Методические аспекты клонирования генов rm [185] 5.2. Факторы, влияющие на успешное клонирование генов rm [188] 5.2.1. Скоординированная экспрессия [188] 5.2.2. Ограничение модифицированной ДНК [191] 5.3. Конструирование продуцентов рестриктаз и метилаз [193] Литература [195] |
Формат: | djvu |
Размер: | 1675329 байт |
Язык: | RUS |
Рейтинг: | 137 |
Открыть: | Ссылка (RU) |