Кинетика биологических процессов. Ч. 2

Автор(ы):Рубин А. Б.
06.10.2007
Год изд.:1997
Издание:2
Описание: Учебное пособие состоит из двух частей: первая часть содержит изложение математического аппарата, применяемого для построения кинетических моделей биологических процессов, вторая - описание кинетических моделей в экологии, ферментативном катализе, фотосинтезе.
Оглавление:
Кинетика биологических процессов. Ч. 2 — обложка книги.
Предисловие ко второму изданию [3]
Из предисловия к первому изданию [5]
Введение [8]
Часть первая Биофизика сложных систем
  Раздел I. Кинетика биологических процессов [15]
    Глава I. Качественные методы исследования динамических моделей [17]
      § 1. Общие принципы описания кинетического поведения биологических систем [17]
      § 2. Качественное исследование простейших моделей биологических процессов [21]
      § 3. Качественные методы исследования систем дифференциальных уравнений [25]
    Глава II. Типы динамического поведения биологических систем [39]
      § 1. Биологические триггеры [39]
      § 2. Колебательные процессы в биологии. Предельные циклы [43]
      § 3. Иерархия времен в биологических системах [49]
      § 4. Стохастические модели взаимодействия [54]
    Глава III. Кинетика ферментативных процессов [61]
      § 1. Простейшие ферментативные реакции [61]
      § 2. Множественность стационарных состояний в ферментативных системах [66]
      § 3. Колебания в ферментативных системах [71]
      § 4. Вероятностное описание переноса электрона в мультиферментном комплексе [77]
    Глава IV. Процессы самоорганизации в распределенных биологических системах [83]
      § 1. Общая характеристика автоволновых процессов [83]
      § 2. Математические модели самоорганизующихся структур [86]
      § 3. Хаотические процессы в детерминированных системах [105]
  Раздел II. Термодинамика биологических процессов [117]
    Глава V. Термодинамика систем вблизи равновесия (линейная термодинамика) [120]
      § 1. Первый и второй законы термодинамики [120]
      § 2. Второй закон термодинамики в открытых системах [123]
      § 3. Соотношение между значениями движущих сил и скоростей процессов [129]
      § 4. Термодинамические критерии достижения и устойчивости стационарных состояний [137]
    Глава VI. Термодинамика систем вдали от равновесия (нелинейная термодинамика) [145]
      § 1. Общие критерии устойчивости стационарных состояний [145]
      § 2. Термодинамика нелинейных кинетических систем [151]
      § 3. Энтропия, информация и биологическая упорядоченность [156]
Часть вторая Молекулярная биофизика
  Раздел III. Пространственная организация биополимеров [167]
    Глава VII. Пространственные конфигурации полимерных молекул [169]
      § 1. Статистический характер организации полимеров [169]
      § 2. Объемные взаимодействия и переходы глобула—клубок в полимерных макромолекулах [174]
      § 3. Фазовые переходы в белках [178]
    Глава VIII. Различные типы взаимодействий в макромолекулах [183]
      § 1. Взаимодействия Ван-дер-Ваальса [183]
      § 2. Водородная связь. Заряд-дипольные взаимодействия [189]
      § 3. Внутреннее вращение и поворотная изомерия [191]
    Глава IX. Конформационная энергия и пространственная организация биополимеров [198]
      § 1. Конформационная энергия полипептидной цепи [198]
      § 2. Предсказания пространственной организации белков [206]
      § 3. Особенности пространственной организации нуклеиновых кислот [217]
      § 4. Состояние воды и гидрофобные взаимодействия в биоструктурах [229]
      § 5. Динамика фазовых переходов в макромолекулах [239]
      § 6. Сворачиваемость белка [244]
  Раздел IV. Динамические свойства глобулярных белков [255]
    Глава X. Динамика белков [256]
      § 1. Структурные изменения белков [256]
      § 2. Конформационная подвижность белков по данным различных методов [263]
    Глава XI. Физические модели динамической подвижности белков [298]
      § 1. Модель ограниченной диффузии (броуновский осциллятор с сильным затуханием) [298]
      § 2. Модель дискретных состояний и фазовых переходов [306]
      § 3. Численное моделирование молекулярной динамики белков [308]
      § 4. Молекулярная динамика белка [327]
      § 5. Общая характеристика молекулярной динамики биополимеров [333]
      § 6. Нелинейные модели подвижности ДНК [340]
  Раздел V. Электронные свойства биополимеров [351]
    Глава XII. Электронные переходы в биополимерах [352]
      § 1. Квантово-механические представления об электронном строении молекул [352]
      § 2. Электронные спектры биополимеров [362]
      § 3. Оптическая активность биополимеров [367]
    Глава XIII. Механизмы переноса электрона и миграции энергии в биоструктурах [372]
      § 1. Биологические примеры [372]
      § 2. Переходы в двухуровневой системе [375]
      § 3. Туннельный эффект [378]
      § 4. Переходы в двухуровневой системе при наличии диссипативных процессов [382]
      § 5. Электронно-колебательные взаимодействия в молекулах [383]
      § 6. Случай сильной и слабой электронно-колебательной связи [388]
      § 7. Перенос электрона по белковой цепи [392]
      § 8. Индуктивно-резонансный механизм [399]
      § 9. Обменно-резонансный перенос энергии [402]
      § 10. Экситонный механизм [404]
      § 11. Динамика электронно-конформационных взаимодействий [407]
    Глава XIV. Механизмы ферментативного катализа [419]
      § 1. Физико-химическое описание и биофизические модели ферментативных процессов [419]
      § 2. Электронно-конформационные взаимодействия в ферментативном катализе [425]
      § 3. Динамика фермент-субстратных взаимодействий [427]
      § 4. Электронные взаимодействия в активном центре фермента [434]
Рекомендуемая литература [441]
Предметный указатель [443]
Формат: djvu
Размер:4214960 байт
Язык:RUS
Рейтинг: 237 Рейтинг
Открыть: