Химические приложения топологии и теории графов

Автор(ы):Кинг Р.
06.10.2007
Год изд.:1987
Описание: Рассматривается применение математического аппарата для описания молекулярных структур в современной теоретической органической химии. Отраженная в книге область топологического анализа охватывает теорию молекулярных структур, стереохимию, химию полимеров, кластеров и комплексных соединений, свойства и пути превращения молекул химических соединений. Авторы статей – ученые из разных стран (США, Канада, Великобритания, Югославия, Польша и др.).
Оглавление:
Химические приложения топологии и теории графов — обложка книги.
Предисловие редактора перевода [5]
Предисловие к русскому изданию [9]
Предисловие [10]
ТОПОЛОГИЯ КОНЕЧНОГО ТОЧЕЧНОГО МНОЖЕСТВА И МОЛЕКУЛЯРНАЯ СТРУКТУРА. Р. Меррифилд, X. Симмонс [11]
  1. Введение [11]
  2. Конечная топология [12]
    2.1. Граф топологии [12]
    2.2. Качественные характеристики графовой топологии [14]
    2.3. Количественные характеристики графовой топологии: комбинаторика [16]
  3. Топология альтернантных молекул [18]
    3.1. Сложность структуры [18]
    3.2. Связность и делокализация [21]
  4. Топология неальтернантных молекул [25]
    4.1. Дуплекс графа [25]
    4.2. Топология дуплекса [27]
  Литература [27]
СТЕРЕОХИМИЧЕСКАЯ ТОПОЛОГИЯ. Д. Волба [28]
  1. Введение [29]
  2. Подход к синтезу топологических стереоизомеров, основанный на лентах Мебиуса [31]
    2.1. Полный синтез первой молекулярной ленты Мебиуса [35]
  3. Критерии топологической стереоизомерии [37]
    3.1. Топологическая хиральность [37]
    3.2. Топологическая диастереоизомерия [41]
  4. «Клиппинг»-реакция (clipping reaction) и подходы к синтезу молекулярного трилистного узла [41]
    4.1. Разрыв ступеней мебиусовой лестницы [41]
    4.2. Молекулярный трилистный узел [42]
  Литература [45]
КАЧЕСТВЕННАЯ СТЕРЕОХИМИЯ Дж. Дугунджи [47]
  1. Введение [47]
  2. Пермутационные изомеры [48]
  3. Группа химической идентичности [50]
  Литература [53]
ТЕОРИЯ МОЛЕКУЛЯРНОЙ СТРУКТУРЫ. Р. Бейдер [54]
  1. Обзор теории [56]
  2. Некоторые приложения [64]
  Литература [71]
АЛГЕБРАИЧЕСКАЯ И ТОПОЛОГИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КВАНТОВОЙ ХИМИИ, ХИМИЧЕСКОЙ КИНЕТИКИ И НАГЛЯДНЫЕ ПРАВИЛА, ПОЗВОЛЯЮЩИЕ СДЕЛАТЬ КАЧЕСТВЕННЫЕ ПРОГНОЗЫ ДЛЯ ХИМИЧЕСКОЙ ПРАКТИКИ. О. Синаноглу [72]
  1. Введение [73]
  2. Микрохимия или качественные квантовохимические правила, полученные непосредственно из структурных формул или диаграмм ORTEP [73]
    2.1. Поле векторного пространства валентностей Vn(R), существующее в евклидовом трехмерном пространстве (?) [74]
    2.2. Принцип линейной ковариантности в квантовой химии [76]
    2.3. Неунитарная классификация молекул [77]
    2.4. От структурных формул молекул к более детальным структурно-электронным формулам (и к графам) [80]
    2.5. «Структурная и деформационная ковариантность» молекул и графические правила для получения качественных квантовохими-ческих результатов [81]
  3. Морфология реакционных механизмов, путей синтеза и топологические «правила стадия/соединение» [86]
  4. Особенности получения квантовых качественных характеристик каждой реакционной стадии механизма или пути реакции [89]
  Литература [89]
РЕАКЦИОННАЯ ТОПОЛОГИЯ: ТЕОРИЯ МНОГООБРАЗИЙ ПОТЕНЦИАЛЬНЫХ ПОВЕРХНОСТЕЙ И КВАНТОВОХИМИЧЕСКИЙ ДИЗАЙН СИНТЕЗА. П. Межей [91]
  1. Введение [91]
  2. Топологические многообразия, дифференцируемые многообразия и реакционная топология [93]
  3. Соотношения критических точек; графы пересечения в топологическом пространстве (М, Тс) и квантовохимические схемы реакций [101]
  4. Вычислительные аспекты [106]
  5. Вырожденные критические точки и химические структуры, не отвечающие истинным минимумам ППЭ [108]
  6. Выводы [110]
  Литература [111]
ТОПОЛОГИЯ СВЯЗЫВАНИЯ В ПОЛИЭДРИЧЕСКИХ МОЛЕКУЛАХ. Р. Кинг [117]
  1. Введение [118]
  2. Основа концепции [119]
  3. Атомы вершин [120]
  4. Полиэдрические системы с локализованным связыванием [123]
  5. Системы с полностью делокализованным связыванием [124]
  6. Электронно-избыточные полиэдрические системы [128]
  7. Электронно-дефицитные полиэдрические системы [133]
  8. Аномальные вершины [134]
  9. Полиэдраны [138]
  10. Выводы [144]
  Литература [146]
ФОРМЫ КЛАСТЕРОВ ЭЛЕМЕНТОВ ГЛАВНЫХ ПОДГРУПП: ТОПОЛОГИЧЕСКИЙ ПОДХОД К СЧЕТУ СКЕЛЕТНЫХ ЭЛЕКТРОНОВ. М. Мак-Глинчи, Й. Таль [148]
  1. Введение [148]
  2. Кластеры с полностью делокализованным связыванием [149]
  3. Кластеры с локализацией связывания на ребрах [153]
    3.1. Шестиатомные кластеры [156]
    3.2. Семиатомные кластеры [158]
    3.3. Восьмиатомные кластеры [159]
  4. Квантово-топологическое обоснование полиэдрической модели [161]
  5. Выводы [165]
  Литература [165]
ТОПОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА БИНАРНЫХ СОЕДИНЕНИЙ СЕРЫ С АЗОТОМ. А. Тернер [167]
  1. Введение [167]
  2. Прототипная молекула — тетранитрид тетрасеры [168]
  3. Плоские циклические молекулы и ионы SnNm [170]
  4. Неплоские системы — эквивалентность центров зарядового распределения [171]
  5. Применение теории функционала электронной плотности [173]
  Литература [181]
СЛЕДУЕТ ЛИ ЗАНИМАТЬСЯ РАЗРАБОТКОЙ ТОПОЛОГИЧЕСКИХ ИНДЕКСОВ? Д. Руврэ [183]
  1. Введение [183]
  2. Индекс Винера [184]
  3. Конструирование индексов [186]
  4. Индексы матрицы расстояний [187]
  5. Индексы матрицы смежности [190]
  6. Центрические топологические индексы [191]
  7. Теоретико-информационные индексы [192]
  8. Составные топологические индексы [193]
  9. Некоторые математические соотношения [194]
  10. Форма и размер молекул [196]
  11. Основные применения индексов [197]
  12. Библиографическая классификация соединений [197]
  13. Определение физико-химических параметров [199]
  14. Разработка фармацевтических лекарственных препаратов [200]
  15. Выводы [202]
  Литература [203]
ТОПОЛОГИЧЕСКИЕ ИНДЕКСЫ, ОСНОВАННЫЕ НА СИММЕТРИИ ОКРЕСТНОСТЕЙ: ХИМИЧЕСКИЕ И БИОХИМИЧЕСКИЕ ПРИМЕНЕНИЯ. В. Магнусон, Д. Харрис, С. Бейсак [206]
  1. Введение [206]
  2. Информационное содержание графа [210]
    2.1. Определения [210]
    2.2. Основные положения [211]
    2.3. Соотношение эквивалентности [212]
    2.4. Расчет других топологических индексов [213]
  3. Расчет индексов [213]
  4. Применения при исследованиях количественных корреляций структура—активность (ККСА) [217]
    4.1. Растворимость спиртов [217]
    4.2. Ингибирование микросомального пapa-гидроксилирования анилина спиртами [217]
    4.3. Токсичность (LD50) барбитуратов [218]
  Литература [220]
УПОРЯДОЧИВАНИЕ ГРАФОВ КАК ПОДХОД К ИССЛЕДОВАНИЯМ КОРРЕЛЯЦИЙ СТРУКТУРА—АКТИВНОСТЬ. М. Рандич, Дж. Краус, Б. Дзонова-Джерман-Блазич [222]
  1. Введение [222]
  2. Основные принципы метода [224]
  3. Применение к веществам, обладающим антималярийным действием [226]
    3.1. Построение последовательности цепей [227]
    3.2. Сравнение молекул А—М [230]
  4. Обсуждение [233]
  Литература [235]
МАТЕМАТИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ МОЛЕКУЛЯРНОЙ СЛОЖНОСТИ. С. Бертц [236]
  1. Ваедение [236]
  2. Разработка модели [237]
    2.1. Теория графов и молекулярная топология [238]
    2.2. Теория информации и молекулярная симметрия [242]
  3. Проверка модели [245]
    3.1. Ограничения модели [250]
  4. Надежность модели [251]
  5. Выводы [256]
  Литература [257]
МАТРИЦА РАССТОЯНИЙ ДЛЯ МОЛЕКУЛ, СОДЕРЖАЩИХ ГЕТЕРО-АТОМЫ. М. Бариш, Дж. Яшари, Р. Лалл, В. Шривастава, И. Тринайстич [259]
  1. Введение [259]
  2. Взаимосвязь между матрицей смежности и матрицей расстояний [260]
  3. Матрица расстояний для гетеросистем [261]
  Литература [265]
КАНОНИЧЕСКАЯ НУМЕРАЦИЯ И СИСТЕМА ЛИНЕЙНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ ХИМИЧЕСКИХ ГРАФОВ. У. Херндон [266]
  1. Введение [266]
  2. Каноническая нумерация [268]
  3. Однозначные линейные обозначения [271]
  4. Каноническая нумерация регулярных графов [273]
  5. Выводы [275]
  Литература [276]
СИММЕТРИЯ И СПЕКТРЫ ГРАФОВ. ИХ ПРИМЕНЕНИЯ В ХИМИИ. К. Баласубраманиан [278]
  1. Введение [278]
  2. Обрезка деревьев [279]
  3. Обрезка деревьев и группы симметрии деревьев [281]
  4. Спектральные полиномы деревьев, получаемые с помощью процесса обрезки [283]
  5. Применения в химии [285]
  Литература [286]
ГРУППЫ АВТОМОРФИЗМОВ НЕКОТОРЫХ ХИМИЧЕСКИХ ГРАФОВ. Г. Джонс, Э. Ллойд [288]
  1. Введение [288]
  2. Некоторые графы и их группы [289]
  3. Реакционные графы [291]
    3.1. Пример 1: механизм Берри [292]
    3.2. Пример 2: 1,2-сдвиги в карбониевых ионах [293]
    3.3. Пример 3: 1,2-сдвиги в гомотетраэдранильных катионах [294]
    3.4. Пример 4: дигональные твисты в октаэдрических комплексах [296]
    3.5. Пример 5: 1,3-сдвиги в гомотетраэдранильных катионах [297]
  4. Суборбитальные графы [298]
  5. Выводы [302]
  Литература [303]
ПРОБЛЕМА РЕКОНСТРУКЦИИ. У. Татт [304]
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ РИМАНОВЫХ ПОВЕРХНОСТЕЙ В ТЕОРЕТИКО-ГРАФОВОМ ПРЕДСТАВЛЕНИИ МЁБИУСОВСКИХ СИСТЕМ. А. Дей, Р. Маллион, М. Ригби [309]
  1. Введение [309]
  2. Формализм метода [310]
  3. Применение [315]
  4. Выводы [318]
  Литература [320]
ГЛОБАЛЬНАЯ ДИНАМИКА НЕКОТОРЫХ КЛАССОВ РЕАКЦИОННЫХ СИСТЕМ. X. Отмер [322]
  1. Введение [322]
  2. Теоретико-графовая формулировка [325]
    2.1. Структура управляющих уравнений [325]
    2.2. Некоторые понятия теории графов [327]
    2.3. Инварианты реакции [332]
    2.4. Существование стационарных состояний [335]
  3. Вершинно-управляемые сети [341]
    3.1. Постоянные входные потоки [341]
    3.2. Периодические входные потоки [345]
  4. Выводы [346]
  Литература [348]
«ЛОГИЧЕСКОЕ ОПИСАНИЕ» В СРАВНЕНИИ С «НЕПРЕРЫВНЫМ ОПИСАНИЕМ» СИСТЕМ, СОДЕРЖАЩИХ ПЕТЛИ ОБРАТНОЙ СВЯЗИ: СООТНОШЕНИЕ МЕЖДУ ЗАПАЗДЫВАНИЯМИ ПО ВРЕМЕНИ И ПАРАМЕТРАМИ. Р. Томас [349]
  1. Введение [349]
  2. Логическое описание систем, содержащих петли обратной связи [351]
    2.1. Запаздывания «включения» и «выключения» [352]
    2.2. Логические уравнения [353]
    2.3. Таблицы состояний [353]
    2.4. Цепи (последовательности состояний) [355]
    2.5. Анализ устойчивости [357]
  3. Непрерывное описание [358]
    3.1. Логические запаздывания по времени и непрерывные параметры [360]
  Литература [365]
КАЧЕСТВЕННАЯ ДИНАМИКА И УСТОЙЧИВОСТЬ ХИМИЧЕСКИХ РЕАКЦИОННЫХ СИСТЕМ. Б. Кларк [367]
  1. Введение [367]
  2. Задание химической системы [368]
  3. Масштабы времени — удаление веществ, реагирующих слишком быстро и слишком медленно [371]
  4. Теория химических сетей [373]
  5. Динамика системы [375]
  6. Многообразие стационарных состояний [376]
  7. Простые теоремы для анализа сетей [379]
  8. Более глубокое обсуждение стационарных состояний и их существования [382]
  9. Правильность [385]
  10. Однозначность [385]
  11. Глобальное притяжение [386]
  12. Сети, в которых многообразием не является правильным, однозначным и глобально притягивающим [388]
  13. Топология сети и устойчивость [389]
  14. Заключительные замечания [390]
  15. Приложение [390]
    15.1. Универсальные функции [392]
    15.2. Функции для символьной обработки и расчета матрицы токов [393]
    15.3. Функции, проверяющие выполнение теорем, и родственные функции [400]
    15.4. Отдельные функции [404]
  Литература [405]
ВЫСШИЙ ХАОС В ПРОСТЫХ РЕАКЦИОННЫХ СИСТЕМАХ. О. Ресслер, Дж. Хадсон [407]
  1. Введение [407]
  2. Метод порождения обыкновенного хаоса [408]
  3. Метод порождения высшего хаоса [411]
  4. Обсуждение [412]
  Литература [413]
СТРАННЫЕ АТТРАКТОРЫ В ЛИНЕЙНЫХ ПЕРИОДИЧЕСКИХ ПЕРЕДАТОЧНЫХ ФУНКЦИЯХ С ПЕРИОДИЧЕСКИМИ ВОЗМУЩЕНИЯМИ. X. Дегн [415]
  1. Введение [415]
  2. Результаты [416]
  Литература [421]
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ АНАЛИЗА ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ ПРИ ОПРЕДЕЛЕНИИ СТРУКТУРНОЙ УСТОЙЧИВОСТИ МНОГОПАРАМЕТРИЧЕСКИХ ОСЦИЛЛЯТОРОВ. Р. Лартер [422]
  1. Введение [422]
  2. Метод [423]
    2.1. Стандартная теория [424]
    2.2. Модифицированная теория [425]
  3. Результаты [426]
    3.1. Начальные условия [426]
    3.2. Константы скорости [429]
    3.3. Более сложные ситуации [430]
  Литература [430]
ПРЕДСТАВЛЕНИЕ n-МЕРНЫХ ХИМИЧЕСКИХ МНОГООБРАЗИЙ С ПОМОЩЬЮ ЭЛЕКТРИЧЕСКИХ СЕТЕЙ. Л. Пьюзнер [431]
  1. Введение: топологический и геометрический анализ химических процессов [431]
  2. Основные геометрические свойства n-мерных метрических многообразий [432]
  3. Представление в виде сети [433]
  4. Пример для двумерной системы [436]
  5. Оптимальные пути [438]
  6. Пример использования химической сети для линейных переходов между множественными состояниями [440]
  7. Вариационные сети [443]
  Приложение: анализ сетей [444]
  Литература [444]
ЛОГИКА ХИМИЧЕСКИХ ИДЕИ. П. Плят, Е. Хасс [445]
  1. Введение [445]
  2. Топология перициклических реакций [445]
  3. Решетки перициклических реакций [447]
  4. Ортомодулярные и булевы реакционные четырехмерные решетки [452]
  5. Выводы [455]
  Литература [456]
МНОГОМЕРНАЯ Х-МОДЕЛЬ. ТЕОРЕТИКО-ГРАФОВЫЙ И АЛГЕБРАИЧЕСКИЙ ПОДХОД К ОПИСАНИЮ МЕХАНИЗМОВ СЛОЖНЫХ ХИМИЧЕСКИХ РЕАКЦИЙ. Е. Хасс, П. Плят [457]
  1. Введение [457]
  2. Однопараметрическая Х-модель [459]
  3. Многомерная Х-модель [463]
    3.1. Реакционные пути для [2+2]-циклоприсоединений [467]
  4. Выводы [470]
  Литература [470]
КЛАССИФИКАЦИЯ МЕХАНИЗМОВ ХИМИЧЕСКИХ РЕАКЦИЙ С ГЕОМЕТРИЧЕСКОЙ ТОЧКИ ЗРЕНИЯ. П. Селлерс [472]
  1. Введение [472]
  2. Пример Мильнера [473]
  3. Механизмы без циклов [475]
  4. Другие механизмы [477]
  5. Множественные суммарные реакции [478]
  6. Выводы [480]
  Литература [480]
ГРАФЫ, МОДЕЛИ ПОЛИМЕРОВ, ИСКЛЮЧЕННЫЙ ОБЪЕМ И ХИМИЧЕСКАЯ РЕАЛЬНОСТЬ. Д. Клейн, В. Зайтц [481]
  1. Введение [481]
  2. Изолированные линейные цепи [483]
  3. Подсчет изомеров [485]
  4. Конформации разветвленных полимеров [489]
  5. Теория скейлинга [489]
  6. Матрицы переноса [491]
  7. Самоподобие и перенормировка [493]
  8. Обсуждение [495]
  Литература [497]
ФУНКЦИЯ ОБЪЕМА ДЛЯ ВОДЫ, ОСНОВАННАЯ НА МОДЕЛИ СЛУЧАЙНОГО ПОДГРАФА РЕШЕТКИ. Л. Квинтас [499]
  1. Введение и предварительные математические замечания [499]
  2. Модель случайных графов для воды [501]
  3. Функция объема для воды [503]
  4. Соответствие V(p) численным данным [504]
  5. Заключительные замечания [506]
  Литература [507]
ТОПОЛОГИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ФЕРМЕНТ-СУБСТРАТНОГО РАСПОЗНАВАНИЯ. С. Сваминатан [508]
  1. Проблема фермент-субстратного распознавания [508]
  2. Модель Эдельштейн—Розена [510]
  3. Метод феноменологического исчисления [512]
  4. Гильбертово пространство описания [512]
  5. Постулаты для динамики сложных систем [514]
  6. Модель фермент-субстратного распознавания [515]
  7. Заключительные замечания [517]
  Литература [517]
ДИНАМИКА ОБРАЗОВАНИЯ ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ РНК. X. Мартинец [518]
  1. Введение [518]
  2. Методы минимизации энергии [521]
  3. Метод моделирования [525]
  4. Выводы [529]
  Литература [529]
ПРОГРАММА НА ЯЗЫКЕ ЛИСП ДЛЯ ФУНКЦИОНАЛЬНО-ФРАГМЕНТНОГО ПРЕДСТАВЛЕНИЯ МОЛЕКУЛ И ИХ ГЕОМЕТРИИ. К. Триндл, Р. Гиван [530]
  1. Введение [530]
  2. Лисп — язык нечисленного программирования [531]
  3. Представление молекул с помощью языка лисп [533]
  4. Неформальный алгоритм распознавания фрагментов [534]
  5. Некоторые специальные проблемы [538]
  6. Построение матрицы расстояний с помощью банка данных о фрагментах [539]
  7. Факторный анализ и алгоритм Криппена определения геометрии через расстояния [540]
  8. Выводы и перспективы [541]
  Литература [543]
Предметный указатель [544]
Формат: djvu
Размер:4289323 байт
Язык:РУС
Рейтинг: 279 Рейтинг
Открыть: